南宗为吕祖传道明悟帝君刘海蟾，刘海蟾至张伯端而创建。全真教在形成之后，宋末元初，龙门派祖师丘处机真人以七十高龄，万里西游，一言止杀劝谏成吉思汗，被崇奉为“神仙”，极大的改变了蒙古在中原地区的策略；在当时的历史条件下，保存与发扬了华夏文明，促使对中原地区政策的改变；当时邱祖得赐虎符，救人无数，挽救黎民百姓与水火之中，很多仁人志士为了更好的传承华夏文明，拜入全真门下，由此全真大兴，为全真道和整个道教的发展起到了积极作用，为华夏文明的传承起到了不可忽视的作用，在一定意义上，邱祖西游甚至高于玄奘西游的价值。跳出历史的局限，我们都承负前人的所为，在这个承负下，我们看到了现在的中华文明。随着历史的发展，全真教高低起伏，传承今日，历史八百余载，文明不断，在坎坷的中华文明中始终薪火相传严谨的道教科仪。目前有天下道教龙门半的说法，意思是，看到的道士，有一大半的几率是全真教龙门派的道士。
全真教的教义总体来说，在炼养上祖述黄老，继承了还黄帝、老子、尹喜、文子、列子、庄子、屈原、魏伯阳、钟离权、吕洞宾的思想。此外，提倡三教平等，但认为儒、道、释的核心都是“道”。其宗教实践的原则是“苦己利人”。而且实行出家制度，道士不鼓励婚娶。全真教除了继承了中国传统道家思想以外，更将符箓、丹药、斋醮科仪等思想文化内容重新整理，为今时今日的道教奠下了坚实的根基。该教教义受时代思潮影响，力主三教平等，以《道德经》、《般若心经》、《孝经》作为宣传口号。修行智慧则以祖经《道德经》、《四子真经》、《文始真经》、《清净经》、《四品经》为主；修行方术以华夏内丹为主，兼修外丹符箓，主张性命双修，先修性，后修命。认为修真养性是道士修炼唯一正道 ，除情去欲，明性见道，使心地清静，才能返朴归真，证道成仙。规定道士须出家住观，严守戒律，苦己利人。对犯戒道士有严厉惩罚，从跪香、逐出直至处死。金元之际邱处机嗣教时，全真道得到大发展。
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